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LIBSVM -- A Library for Support Vector Machines  

2009-11-07 06:42:20|  分类: Bioinformatics |  标签: |举报 |字号 订阅

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http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/libsvm/index.html

 

Bioinformatics
– Original sets with default parameters
$ ./svm-train -v 5 train.2
→ Cross Validation Accuracy = 56.5217%
– Scaled sets with default parameters
$ ./svm-scale -l -1 -u 1 train.2 > train.2.scale
$ ./svm-train -v 5 train.2.scale
→ Cross Validation Accuracy = 78.5166%
– Scaled sets with parameter selection
$ python grid.py train.2.scale
· · ·
2.0 0.5 85.1662
→ Cross Validation Accuracy = 85.1662%
(Best C=2.0, γ=0.5 with ?ve fold cross-validation rate=85.1662%)

– Using an automatic script
$ python easy.py train.2
Scaling training data...
Cross validation...
Best c=2.0, g=0.5
Training...

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