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SVM学习  

2009-05-06 21:59:19|  分类: 生物信息编程 |  标签: |举报 |字号 订阅

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open(ONE,"dohao.txt");
@ARGV = <ONE>;
$n=0;
while($n<4132){

$wei=$n-1;
$wei2=$n+1;

open(TM,">data.txt");#放到while内部否则不打印到文件
print TM @ARGV[0..$wei];
print TM @ARGV[$wei2..4132];

      open(TWO,">line.txt");
     $bug=$ARGV[$n];
     $bug=~s/^\d{1,2}\s/0 /; #bug行被替换了.
      print TWO $bug;

    system "./svm_multiclass_learn -c 100 data.txt model222.dat"; # 得出训练集
    system "./svm_multiclass_classify  line.txt model222.dat  lishire.txt"; #用训练集作为对象来预测line.txt

open(SE,"lishire.txt");
open(RE,">>0.4result.txt");
while($jie=<SE>){
  print RE $jie;

}
$n=$n+1;
}

 

 

dohao.txt 数据格式

 1 1175:1
1 445:1 946:1
2 329:1 341:1 608:2 872:1
2 329:1
2 159:1
2 473:1
2 218:1

http://www.cs.cornell.edu/People/tj/svm_light/svm_struct.html

 

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