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tophat junction format  

2012-05-10 10:42:50|  分类: 生物信息编程 |  标签: |举报 |字号 订阅

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track name=junctions description="TopHat junctions"
junnction id: JUNC00000001
chromosome: sg0.contig33242
junction start-end: 2459-2641
strand: +
Depth 3
Flanking widths: 40,36
blockCount: 2 (255,0,0 2)
itemRgb: 255,0,0 (255,0,0 2) 
block size: 40,36 ( A comma-separated list of the block sizes. The number of items in this list should correspond to blockCount)

blockStarts:0,146 - A comma-separated list of block starts. All of the blockStart positions should be calculated relative to chromStart. The number of items in this list should correspond to blockCount.

sg0.contig33242 2459 2641 JUNC00000001 3 + 2459 2641 255,0,0 2 40,36 0,146
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